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这本秘籍是大明尊教的核心传承，自然也是跟教义相关！
大明尊教源于波斯“祖尊”摩尼创的“二宗三际论”，讲的是明暗对待的两种终极力量，而“御尽万法根源智经”的修持之法就是通过这两种敌对的力量，由明转暗，从暗归明，只有通过明暗的斗争，始能还原太初天地未开之际明暗各自独立存在的平衡情况。
总纲核心经文——初际未有天地，但殊明暗，暗既侵明，恣情驰逐。
明来入暗，委质推移。
圣教固然，即妄为真，孰敢闻命，求解脱缘。
教化事毕，真妄归根，明既归于大明，暗亦归于积暗。
二宗各复，两者交归。
只要明白了这个主旨，那么修行《御尽万法根源智经》绝不会再有问题。
杨伊翻看这秘籍修习之法，发现这一门武功则有两种修炼方法。
